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NIES collection MICROBIAL CULTURE COLLECTION General information Search on strains data List of strains Taxonomic index Alphabetical index How to order Cart Japanese HOME Search Strain Data Strain Data Strain Data Strain Data Reference --> Strain number NIES-27   Phylum Cyanophyta   Class Cyanophyceae   Scientific name Spirulina subsalsa Oersted ex Gomont   Synonym   Former name   Common name Blue-green alga ; Cyanobacteria   Locality (Date of collection)   Latitude / Longitude   Habitat (Isolation source)   History Isolator (Date of isolation)   Identified by   State of strain Cryopreservation; Unialgal; Clonal; Axenic[2014 Jan.]   Culture condition (Preculture condition) Medium:  MA   Temperature:  24 C Light intensity:  14-17 µmol photons/m2/sec, L/D cycle:  10L:14D Duration:  42 D   Gene information 16S rRNA ( AB003166 )   Cell size (min - max) - 12 μm   Organization Filamentous  Characteristics   Other strain no. Other collection strain no. : IAM M-183 (=M-223)   Remarks Cryopreserved; Axenic  Movie https://www.youtube.com/watch?v=jqmO7KIUweE&index=14&list=PLFTJlLsZcVbiJY3ygYAPKeVOfDdOh9UEW&t=0s   Reference Okamoto, Y., Haraguchi, Y., Sawamura, N., Asahi, T., Shimizu, T. 2020 Mammalian cell cultivation using nutrients extracted from microalgae. Biotechnol. Prog., 36, e2941 (article ID). Keywords: acidic hydrolysis; amino acids; glucose; mammalian cell culture; microalgae; nutrients Strain(s): 27,  39,  49,  2170  PubMed: 31756286 DOI: 10.1002/btpr.2941 Asukabe, H., Akahori, S., Ueno, E., Nakayama, T., Yamashita, R., Arii, S., Harada, K., Imanishi, S. Y. 2020 Cyanobacterial classification with the toxicity using MALDI Biotyper. J. Am. Soc. Mass Spectrom., 31, 1572-1578. Keywords: cyanobacteria; MALDI Biotyper; microcystins; profiling Strain(s): 27,  39,  42,  73,  81,  87,  89,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  107,  111,  112,  207,  208,  230,  266,  298,  416,  433,  478,  510,  512,  515,  592,  593,  604,  611,  808,  809,  835,  843,  846,  847,  905,  928,  931,  932,  945,  981,  989,  1025,  1043,  1058,  1061,  1064,  1068,  1069,  1071,  1076,  1085,  1099,  1101,  1105,  1113,  1115,  1126,  1133,  1134,  1135,  1144,  1157,  1215,  1642,  1643,  1652,  1668,  1672,  1673,  1677,  1678,  1698,  2087,  2131,  2412,  2665,  3708,  3733,  3734,  3736,  3755,  3756,  3757  PubMed: 32501712 DOI: 10.1021/jasms.0c00148 Mori, F., Erata, M., Watanabe, M. M. 2002 Cryopreservation of cyanobacteria and green algae in the NIES-Collection. Microbiol. Cult. Coll., 18, 45-55. Keywords: cryopreservation; cyanobacteria; green algae; FDA staining method; NIES-Collection Strain(s): 19,  21,  22,  23,  24,  25,  26,  27,  28,  29,  30,  31,  32,  33,  34,  35,  36,  37,  38,  39,  40,  41,  44,  45,  46,  50,  51,  52,  53,  54,  55,  56,  58,  59,  60,  61,  62,  63,  64,  65,  66,  67,  68,  69,  70,  73,  74,  75,  76,  77,  78,  79,  80,  81,  87,  89,  90,  91,  92,  93,  94,  95,  96,  97,  98,  99,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  106,  107,  108,  109,  110,  111,  112,  119,  120,  122,  123,  125,  127,  128,  129,  130,  131,  132,  133,  134,  135,  137,  138,  139,  144,  147,  151,  152,  153,  154,  155,  156,  157,  158,  159,  160,  162,  163,  164,  165,  166,  167,  168,  170,  171,  172,  173,  174,  175,  176,  177,  178,  179,  180,  181,  182,  183,  185,  186,  187,  188,  189,  191,  192,  193,  194,  197,  198,  199,  200,  201,  202,  203,  204,  205,  206,  207,  208,  209,  210,  211,  212,  213,  214,  215,  216,  217,  224,  226,  227,  228,  229,  230,  231,  232,  241,  242,  243,  244,  245,  246,  248,  257,  259,  261,  262,  263,  266,  267,  268,  287,  288,  289,  290,  294,  295,  297,  298,  299,  300,  301,  302,  303,  305,  306,  308,  309,  310,  312,  313,  329,  334,  337,  338,  339,  340,  341,  342,  349,  351,  359,  360,  361,  362,  375,  378,  379,  380,  382,  384,  385,  390,  394,  396,  397,  398,  415,  416,  418,  419,  421,  422,  423,  424,  425,  426,  427,  428,  429,  430,  431,  432,  433,  434,  436,  437,  438,  439,  440,  446,  447,  448,  449,  450,  451,  452,  453,  454,  455,  456,  457,  458,  459,  460,  464,  468,  469,  474,  478,  479,  480,  481,  503,  504,  505,  506,  507,  509,  510,  512,  514,  515,  522,  523,  524,  527,  528,  529,  530,  531,  532,  536,  537,  538,  539,  540,  541,  542,  543,  544,  545,  546,  564,  565,  566,  567,  568,  569,  570,  571,  572,  573,  574,  575,  576,  577,  578,  579,  580,  581,  582,  583,  584,  585,  592,  593,  594,  595,  596,  597,  598,  604,  610,  628,  630,  631,  632,  633,  634,  635,  636,  637,  638,  639,  640,  641,  642,  643,  644,  645,  646,  647,  648,  649,  650,  651,  652,  653,  654,  655,  656,  657,  658,  659,  660,  661,  662,  663,  664,  665,  666,  667,  672,  685,  686,  687,  688,  689,  690,  691,  692,  693,  694,  717,  718,  719,  720,  721,  722,  723,  724,  725,  726,  727,  728,  729  Ishida, T., Watanabe, M. M., Sugiyama, J., Yokota, A. 2001 Evidence for polyphyletic origin of the members of the orders of Oscillatoriales and Pleurocapsales as determined by 16S rDNA analysis. FEMS Microbiol. Lett., 201, 79-82. Keywords: cyanobacterium; Pleurocapsales; 16S rDNA; phylogeny Strain(s): 27,  208,  510,  2116,  2118,  2119,  2128  PubMed: 11445171 DOI: 10.1111/j.1574-6968.2001.tb10736.x Honda, D., Yokota, A., Sugiyama, J. 1999 Detection of seven major evolutionary lineages in cyanobacteria based on the 16S rRNA gene sequence analysis with new sequences of five marine Synechococcus strains. J. Mol. Evol., 48, 723-739. Keywords: cyanobacteria; Synechococcus; phylogeny; ribosomal RNA; maximum-likelihood method; neighbor-joining method; rate homo- and heterogeneous models Strain(s): 27,  208,  510,  2116,  2118,  2119  PubMed: 10229577 DOI: 10.1007/PL00006517 Li, R., Yokota, A., Sugiyama, J., Watanabe, M., Hiroki, M., Watanabe, M. M. 1998 Chemotaxonomy of planktonic cyanobacteria based on non-polar and 3-hydroxy fatty acid composition. Phycol. Res., 46, 21-28. Keywords: 3-hydroxy fatty acids; chemotaxonomy; fatty acid; non-polar fatty acids; planktonic cyanobacteria Strain(s): 27,  40,  44,  76,  78,  79,  80,  81,  87,  89,  98,  102,  104,  111,  112,  204,  205,  207,  298,  604,  810,  821,  825,  826  DOI: 10.1111/j.1440-1835.1998.tb00093.x Ishida, T., Yokota, A., Sugiyama, J. 1997 Phylogenetic relationships of filamentous cyanobacterial taxa inferred from 16S rRNA sequence divergence. J. Gen. Appl. Microbiol., 43, 237-241. Keywords: filamentous cyanobacteria; molecular phylogeny; Oscillatoriales; 16S rRNA Strain(s): 27,  208,  510,  2116,  2118,  2119,  2128  PubMed: 12501325 DOI: 10.2323/jgam.43.237 Hirata, K., Phunchindawan, M., Tukamoto, J., Goda, S., Miyamoto, K. 1996 Cryopreservation of microalgae using encapsulation-dehydration. CryoLetters, 17, 321-328. Keywords: Dunaliella tertiolecta; microalgae; cryopreservation; encapsulation-dehydration Strain(s): 8,  19,  22,  24,  27,  32,  44,  242,  375,  396,  422,  437  Watanabe, Y., Ohmura, N., Saiki, H. 1992 Microbial CO2 fixation. 2. Isolation and determination of cultural characteristics of Chlorella strains which function under CO2 enriched atmosphere. CRIEPI Kenkyû-Hôkoku, U92014, 1-21 (in Japanese with English summary). Keywords: climate change; CO2; CO2 fixation; microalgae; Chlorella Strain(s): 27,  45,  92,  94,  122,  158,  204,  226,  227  Ishikawa, I. S. 1990 Characteristic structures of Spirulina trichome involved in gliding movement. Plant Morphol., 2, 7-14. Keywords: gliding movement; Spirulina; thylakoid; trichome; motive force Strain(s): 27  DOI: 10.5685/plmorphol.2.7 Ichimura, T. & Itoh, T. 1977 17. Preservation methods of microalgae (I) [17. Bisaisôrui no hozonhô (I)]. In Preservation methods of microorganisms [Biseibutsu Hozonhô], Ed. by Nei, T., University of Tokyo Press, Tokyo, pp. 355-373 (in Japanese). Strain(s): 19,  21,  22,  23,  24,  27,  28,  30,  31,  32,  33,  34,  36,  37,  38,  39,  40,  41,  44,  45,  46,  47,  48,  49,  50,  122,  123,  127,  131,  144,  152,  173,  175,  179,  180,  181,  182,  183,  185,  198,  200,  203,  206,  217,  226,  227,  241,  266,  267,  268,  295,  309,  310,  334,  338,  379,  436,  448,  450,  455,  527  Unauthorized copying and replication of text, images, and tables in our homepage, are prohibited. PAGE TOP 16-2 Onogawa, Tsukuba, Ibaraki 305-8506, JAPAN TEL +81-29-850-2556 FAX +81-29-850-2587 Send us an e-mail () FAQ Privacy policy ©National Institute for Environmental Studies. All Rights Reserved. Since 1 October 2001